Глеб Доценко

10 марта 2025 12:00

Четвёртое занятие факультатива

В прошедшую пятницу прошло четвёртое занятие по биоинформатике в рамках нашего кафедрального факультатива.
Присутствовало 18 слушателей.


Мы прошли основы написания скриптов и создали свой первый тестовый скрипт на bash.
По традиции, этот скрипт содержал команду для вывода приветственного сообщения "Hello World!", которое очень часто можно встретить в книгах по программированию. В IT много других традиций, забавных условностей и интересных формальностей, наверное, во многом потому, что программистам нравится придумывать свои правила и делать окружающую реальность более необычной.
Затем мы использовали наш тестовый скрипт, чтобы на практике изучить работу и возможности менеджера задач Slurm. Мы запускали этот скрипт с разными вычислительными ресурсами, поверяли работу отсроченного запуска и запуска при условии выполнения других скриптов. Потом мы попрактиковались в разных способах отмены запущенных работ.
В завершении занятия мы повторили использование часто применяемых команд grep, awk и sort на примере типичной задачи форматирования табличный данных и извлечения строк с нужной информацией средствами bash.


Изображение 2 Изображение 3