Пятое занятие факультатива

Уважаемые слушатели!

Пятое занятие по факультативу состоится по расписанию (пятница, 14 марта, 18 часов). На лекции мы разберём дополнительные возможностям менеджера задач Slurm и команды для работы с программными модулями на кластере.

Поскольку мы прошли базовый подготовительный этап, то начиная с этого занятия, на практикуме мы будем выполнять анализ NGS данных ДНК человека. На предстоящем занятии мы будем выполнять картирование прочтений на референсный геном, поиск генетических вариантов (SNP) и определение митохондриальной гаплогруппы. Попутно мы научимся оценивать качество исходных данных, фильтровать исходные данные и промежуточные результаты, а также начнём знакомиться с основными форматами файлов в биоинформатике и их содержимым.

До встречи на занятии!